אחריות על מיגון אזרחי, לרבות תכנון, הנחיות והכנה למצבי חירום של העורף, מוטלת בעיקר על משרד הביטחון, באמצעות פיקוד העורף ורשות החירום הלאומית (רח"ל), ובשיתוף עם הרשויות המקומיות. משרד החקלאות ופיתוח הכפר אחראי על תחומי החקלאות, פיתוח הכפר, מזון, מים לחקלאות, שירותים וטרינריים, ועוד, ואינו כולל ב mandate שלו את נושא המיגון האזרחי או הקמה ותחזוקה של מיגוניות. לפיכך, הטענה כי המשרד אינו אחראי על נושא זה נכונה.