הטענה לפיה פיקוד העורף קבע הנחיות מחמירות בשטחי מדינת ישראל כולה, שכללו איסור על התקהלויות בשטח פתוח ומתן שירותים, איסור פעילות במקומות עבודה למעט משק חיוני ואיסור פעילות חינוכית, היא נכונה. הנחיות מסוג זה פורסמו והיו בתוקף במספר תקופות חירום, ובראשן בתקופת ההתפרצות הראשונית של נגיף הקורונה במרץ 2020. באותה עת, פיקוד העורף היה הגוף המרכזי שפרסם את הנחיות הממשלה לציבור, אשר כללו סגירה כמעט מוחלטת של מערכת החינוך, הגבלות דרסטיות על התקהלויות, ואיסור על פעילות עסקית שאינה חיונית, והן יושמו ברחבי הארץ. גם במהלך מבצעי ביטחון נרחבים, כמו מלחמת 'חרבות ברזל' באוקטובר 2023 ואילך, פיקוד העורף פרסם הנחיות מחמירות הכוללות הגבלות על התקהלויות ופעילות חינוכית באזורים נרחבים, אם כי לא תמיד כלל ארציות באותה מידה של חומרה.