משרד הבריאות ומשרד החינוך פרסמו הנחיות מפורטות ומיוחדות עבור מעונות סטודנטים ופנימיות במהלך מגפת הקורונה. הנחיות אלו היוו למעשה 'מסלול מיוחד', שכן הן התייחסו לאתגרים הייחודיים של מגורים משותפים וכללו פרוטוקולים ספציפיים לבידוד, סגר, בדיקות תכופות, הגבלות על מבקרים ושמירה על 'קפסולות' או קבוצות מופרדות. תקנות אלה היו נפרדות מההנחיות שהוטלו על הציבור הרחב ונועדו לאפשר למוסדות אלה להמשיך לתפקד תוך מזעור סיכוני הדבקה.