במהלך מחאת ההתנתקות, שהייתה בעיקרה לא אלימה, התרחשו גם עימותים אלימים בין מתנגדי ההתנתקות לכוחות המשטרה. בעוד שרבים מהפינויים התבצעו ללא אלימות, ואף ברגישות מצד הכוחות, היו אירועים חריגים בהם המשטרה השתמשה בכוח. בפינוי עמונה, למשל (שהתרחש לאחר עיקר ההתנתקות אך מוזכר בהקשר דומה), תוארה אלימות חסרת תקדים מצד שוטרי יס"מ שפצעו כ-200 מפגינים. כמו כן, עלו תלונות רבות על שימוש לא חוקי בכוח על ידי המשטרה, ושוטר אחד אף הורשע בגין אלימות קשה כלפי מפגין, שכללה מכות אגרוף, סטירות, נגיחה והטחת ראש בדלת. תיאורים אלו, יחד עם אזכורים כי כוחות מתבצרים ספגו "מהלומות קשות", תומכים בכך שהמשטרה אכן פיזרה מתנגדים במכות ובאמצעי כפייה פיזיים נוספים, כגון אלות, במקרים של התנגדות אלימה.