תוכנית היל"ה פועלת בשיתוף משרד החינוך והרשויות המקומיות, במטרה לסייע לנוער נושר להשלים השכלה. הרשויות המקומיות נושאות בחלק מנטל המימון, הכולל שכר של חלק מאנשי הצוות והוצאות תפעול ותחזוקה של היחידות. אכן קיימת ביקורת מצד נציגי השלטון המקומי על אופן התקצוב, כשהערכות מצביעות על כך שמשרד החינוך מכסה רק עד 30% מהעלות הכוללת של הפעלת היחידות. כמו כן, רשויות חלשות עשויות לקבל תוספת מימון קטנה (5%), מה שמעיד על הכרה בנטל התקציבי עליהן. עם זאת, בחיפוש אחר מידע עדכני סביב תאריך הציטוט (17 בפברואר 2026), לא נמצאו דיווחים או עדויות ספציפיות לכך שמסגרות היל"ה או התוכנית עצמה נסגרות בגלל קשיי מימון של הרשויות המקומיות. התוכנית מתוארת כפעילה ורחבה, ואף מפתחת מיזמים חדשים כמו תוכנית המנטורים שהחלה בשנת הלימודים תשפ"ה (2024-2025).