הטענה כי בנימין גנץ הוא בן לניצולת שואה היא נכונה. אמו, מלכה גנץ (לבית וייס), נולדה בהונגריה ושרדה את מחנה הריכוז ברגן-בלזן. היא עלתה לישראל לאחר השואה. עובדה זו מתועדת היטב בביוגרפיות שלו ובכתבות תקשורתיות רבות.