פקודת מס הכנסה המקורית נחקקה בשנת 1941 ואומצה על ידי מדינת ישראל בשנת 1948, תקופה שבה יהודה ושומרון לא היו בשליטה ישראלית, ולכן לא ניתן היה להחיל אותה עליהם ישירות בזמן חקיקתה. עם זאת, בהתייחס ליישומים המודרניים של הפקודה וההטבות הנגזרות ממנה, תושבי ההתיישבות הישראלים ביהודה ושומרון כפופים לפקודת מס הכנסה ומשלמים מסים לפי הוראותיה. יתר על כן, יישובים רבים ביהודה ושומרון מוגדרים כ'אזורי עדיפות לאומית' או 'יישובים מזכים' בהתאם ל'צו מס הכנסה (הטבות במס לתושבי יישובים מסוימים)'. בכך תושביהם זכאים להטבות מס שונות, לרבות זיכויים ממס הכנסה מכוח סעיף 11 לפקודה, בדומה ליישובים זכאים בתוך גבולות הקו הירוק. לפיכך, הטענה כי הטבות אלו 'לא קרה' (לא ניתנו) שגויה.