ישראל הייתה אחת המדינות הראשונות שהכירו בעצמאותה של דרום סודאן בשנת 2011. מאז, שתי המדינות מקיימות יחסים דיפלומטיים חמים וידידותיים, הכוללים ביקורים הדדיים של בכירים, סיוע הומניטרי ופרויקטים בתחומי החקלאות, הבריאות והתשתיות מצד ישראל. דרום סודאן נמנעת לרוב מהצבעה נגד ישראל בפורומים בינלאומיים ואף תומכת בעמדותיה במקרים מסוימים. יחסים אלו מבוססים על אינטרסים משותפים ועל תחושת קרבה היסטורית, והם מתוארים באופן עקבי כחיוביים וידידותיים במקורות שונים.