במהלך המתקפה האיראנית הראשונה על ישראל באפריל 2024, גדי איזנקוט, יחד עם בני גנץ, דחפו לתגובה ישראלית מיידית וחזקה כשהטילים האיראניים היו בדרכם לישראל. בכירים ישראלים דיווחו כי ראש הממשלה בנימין נתניהו וחברים נוספים בקבינט הסתייגו מהצעה זו. הצעתם של איזנקוט וגנץ ירדה מהפרק לאחר שיחה שניהל נתניהו עם נשיא ארה"ב, ג'ו ביידן, אשר הפעיל לחץ נגד תגובה מיידית וחריפה. איזנקוט עצמו אישר מאוחר יותר, באוגוסט 2024, כי הוא וגנץ דרשו להגיב בעוצמה, אך נתניהו "בחר אחרת".