הטענה כי חברות בחמאס עדיין נחשבת בפועל לדבר מקובל בשורות אונר"א נתמכת על ידי ממצאי חקירה עדכניים ודברי גורמים רשמיים. בחודש יוני 2026, משרד המפקח הכללי של הסוכנות האמריקאית לפיתוח בינלאומי (USAID OIG) חשף כי יותר מ-100 עובדי אונר"א, בהווה ובעבר, קשורים לחמאס או היו מעורבים במתקפת 7 באוקטובר 2023. בין אלו נמנים מנהלי בתי ספר ומורים שאף שימשו בתפקידי פיקוד בזרוע הצבאית של חמאס. ב-12 ביוני 2026, אונר"א פיטרה 70 עובדים בעזה בעקבות חקירה זו, אך בהודעתה ציינה כי הפיטורים אינם מהווים אישור לטענות נגדם וטענה כי לא קיבלה ראיות מישראל. משרד החוץ הישראלי תיאר את הודעת אונר"א כ"טיוח ציני" וקבע במפורש כי "חברות בחמאס עדיין נחשבת בפועל לדבר מקובל בשורות אונר”א". דובר מחלקת המדינה האמריקאית ציין כי "לא מפתיע" שעוד 100 עובדי אונר"א היו מעורבים במתקפה וכי אונר"א "הוחדרה לחלוטין על ידי חמאס ותומכי טרור". גורם אמריקאי בכיר הדגיש גם את "נוהלי הבדיקה הרופפים" במערכת האו"ם. למרות שאונר"א מדווחת על התקדמות ביישום המלצות דו"ח קולונה לחיזוק הניטרליות, היקף המעורבות של עובדיה בחמאס, כפי שנחשף בחקירות, ותגובת הארגון שנתפסת כלא מספקת על ידי גורמים רשמיים, מצביעים על כך שהבעיה של קשרי חמאס בארגון נותרה בעינה הלכה למעשה.